招标竞争性不足
框架招标的最大缺点之一是可能导致招标竞争性的不足。由于框架协议已经事先确定了参与供应商名单，只有这些供应商才能参与后续的具体采购，这样就限制了其他有实力的供应商参与竞争的机会。长期来看，缺乏竞争可能导致供应商的服务质量下降或价格上涨，最终不利于采购方的利益。
供应商依赖性增强
框架招标还可能导致采购方对某些供应商的依赖性增强。框架协议虽然能够提高采购效率，但如果选择的供应商在履约过程中出现问题，采购方只能依赖框架内的有限供应商进行替代，缺乏灵活性。这种情况在一些特殊项目或紧急采购时尤为突出，可能会影响整体采购的顺利进行。
灵活性降低
框架招标还可能导致采购的灵活性降低。因为在框架协议中，很多条件和条款已经预先设定，采购方需要在这些框架条件下进行选择和调整。当市场环境发生变化时，框架招标可能无法迅速适应新变化，导致采购过程变得不够灵活，无法及时调整采购方案或寻找更具竞争力的供应商。
总结来说，尽管框架招标在一定程度上能够提高采购效率，减少重复招标的工作量，但其在竞争性、供应商依赖性和灵活性方面的缺点，依然需要在实际操作中引起足够的重视。